謂廢止八旗，緣起于維新三年年中，但整個過程一直10年。因為，對一樣根本性制度的調整，涉及到方方面面的利益與糾葛，雖然皇帝借著平定親貴叛亂的勢頭以雷霆萬鈞的手段加以勉力推進，但在具體做法上，依然積極穩妥。
以旗兵為例，京師八旗因為駐所地由禁衛軍等擔任衛戍任務，原本就不甚仰仗，廢了亦無大事。但像偏遠地區，譬如黑龍江、譬如西安，都駐有大批旗兵，而且旗兵無論吃苦性與擔任的衛戍任務都要強于京師八旗，那就不是簡單的廢止。
又譬如漢軍旗，滿八旗要廢止，漢軍旗同樣也會跟著廢止。如果不給他們相應的優待，則漢軍旗必定要起來造反，即便不造反，數百萬人懷有怨望也說不定是未來的巨大隱患；但如果給他們與滿八旗相應的待遇，不要說滿八旗會大有意見，就是帝國財政亦難以接受。最後經過商定，漢軍旗廢旗的，安家費發30元，但加上豁免今後5的地丁錢糧這一條款。雙方便是皆大歡喜。
除了滿漢八旗以外，蒙古八旗也是令人相當棘手的問題。皇帝汲取了曆史上清廷在蒙古強硬推行新政，結果造成蒙古王公對中央政權離心離德的教訓，對蒙古方面的改革極為慎重，對蒙古王爺也格外予以優容。最後商定了八項解決意見：
1、蒙古八旗制度，以所在旗王公意見為准，存廢悉聽尊便。朝廷不予干涉。但王公爵位繼承不得朝廷冊封詔書者，視為僭越；
2蒙古可選代表出席帝國國會，名額遵照相應法律，但國會代表如何選定，由蒙古各旗自行商議辦法後報朝廷批准；
3無論蒙八旗存廢與否，蒙古王公所轄衛隊不得超過400，不得私自組軍。蒙古壯丁納入國防部統一的征兵范圍，按《帝國國防法》予以編制，不得違逆；
4蒙古境內土地准自由買賣。但不得售于外人。蒙人售于滿人、漢人者，亦不得阻攔，亦允蒙人入內地收買田產、房產；
5蒙古境內如鐵路、公路、電報局等設施之營建經費。悉由朝廷承擔，所占土地亦以公允價購買，但當地王公不得以其他理由阻撓之；
6蒙古境內的度量衡、錢幣、法律等一切制度，須與朝廷改良後地制度保持一致，但允許保留蒙古傳統與民族特色。朝廷亦極尊重蒙古傳統宗教；
7蒙古子弟倘有聰穎且願意出洋留學者，可由帝國教育部予以考核後直接放洋或入本國大學堂受學預科。經費由朝廷承擔；
8蒙古王公每家應抽調1～2年10歲以上，15以下子弟入京受學。
對蒙古地政策如此，對西藏的政策也是如此。皇帝的意思非常明確，這兩處地方，版圖大、人煙少，文化、交往都處于極其閉塞的境地，傳統習慣力量尤強，對他們加以現代化改造決不可操之過急。最好的辦法便是保持朝廷的傳統掌控與影響，同時增加對現代化信息的溝通與交流，通過潛移默化地滲透而不是強制性的行政命令來改變舊有習俗。同時，皇帝鑒于後世民族政策的教訓，只尊重蒙、藏兩族地民族特色，但並不授予其高于其他民族地權利。
消除民族域，不僅指消除滿漢域，同樣也要消除蒙漢域、藏漢域、滿蒙域等因素。
以維新三年九月初九頒布《蒙古八旗制度籌劃上諭》為標志，滿蒙300來的特殊紐帶和政治聯姻關系宣告在形式上予以消滅，帝國從此視蒙古各部與天下眾民一般，蒙古部落亦不必對朝廷承擔額外的義務。當然，作為既有曆史地傳承，蒙古、滿族與帝國朝廷的特殊聯系不可能一並消逝，皇帝本人在當年就納了蒙古美女海琳為妃，冊封為儀妃，成為皇帝維新以來所納的第三名妃子。
為進一步穩定民族關系，加強邊疆向心力，接下來兩個月，皇帝接連頒布《回部綏靖籌劃上諭》與《藏部綏靖籌劃上諭》兩封詔書。朝廷改變了過去300間對回部的仇視、敵視態度，第一次承認回部擁有與其他各民族相等的平權，願意授予回部在本民族聚居區域類似于蒙古地自治權，可以
定官吏，願意尊重伊斯蘭教在回部的傳教權，回部亦國會代表地名額，一個為弼德院，另兩個為資政院，標志著回部以正常的政治身份參與國家大事，不再負有200來回部勢力稍盛便招來仇殺的包袱，亦不再有左宗棠征回這樣的軍事規模。回部曆經數百年，通過竭力抗爭而不得的民族自主權力，不料竟在一夕之間便得到，皇帝的仁名遠遠歌頌。雖然一紙詔書很難將各民族間上百年的恩怨一朝化解，但有了正確的民族政策，民族糾紛與隔閡總有破冰的結局。
朝廷與西藏的關系因為涉及到中英關系，相對而言比較敏感。皇帝雖然著眼于恢複朝廷對西藏當局的傳統影響力，但英、印當局對西藏的滲透已到了無以複加的地步。更何況，四川等藏邊區域本身並未安定，短時間內出台強硬的軍事解決方案並無可行性，出台進一步穩固、籠絡藏部的政策，減少在西藏強制推行新政的努力，以穩定大局的妥協適應于西藏當前的情況。當然，這只是皇帝不得已而為之的過渡政策。
隨著八旗制度的逐漸廢止，民族域的逐步消融，皇帝對原有的爵位制度亦進行了重大改良。
原本帝國爵位分為宗室爵和功臣爵兩種。宗室爵包括和碩親王、世子（親王嫡子）、多羅郡王、長子（郡王嫡子）、多羅貝勒、固山貝子、鎮國公、輔國公、不入八分鎮國公、不入八分輔國公、一至三等鎮國將軍、一至三等輔國將軍、一至三等奉國將軍、奉恩將軍共14（輔國公之前八等稱入八分公，與之後的不入八分鎮國公、不入八分輔國公等爵位不同）。而功臣世爵分為公、侯、伯、子、男、輕車都尉、騎都尉、云騎尉、恩騎尉九級27等。
根據維新三年十二月初九頒行的《大中華帝國爵位法》規定，帝國爵位不再區分宗室爵和功臣爵兩種，統一納入一個爵位體系，均稱帝國爵位，同時取消原有爵位與官員品秩掛鉤的制度。
新的爵位體系里面，分成親王、郡王、貝勒、貝子、公（一至三等）、侯（一至三等）、伯（一至三等）、子（一至三等）、男（一至三等）、輕車都尉、騎都尉、云騎尉、恩騎尉共13級，27級。
《爵位法》規定，親王、郡王、貝勒、貝子為皇室爵，無皇室血統者不得授予，原有宗室爵中的世子和長子兩級分別改授貝勒和貝子，皇帝之子從貝子開始授爵，鎮國公、輔國公對應為新爵位中的一至二等公，不入八分鎮國公、不入八分輔國公對應為新爵位中的一至二等候，一至三等鎮國將軍對應一至三等伯、一至三等輔國將軍對應一至三等子爵、一至三等奉國將軍對應一至三等男爵。
《爵位法》同時規定了爵位的繼承，區別為世襲罔替與非世襲罔替兩種，倘若是世襲罔替的爵位，那麼授予此爵位後，子孫後代繼承的仍然是這個爵位，級別不會發生動搖，倘若是非世襲罔替的爵位，則每過一代子孫所繼承的爵位就要降等，防止子孫躺在先人的功勞簿上不思進取。但新《爵位法》與舊有規定出入較大的主要有兩個方面，一是降等，原有爵位法規定一代只降一等，新的爵位法規定一代降三等，最多九代降完，二是授爵時間，原先宗爵子弟一出生就有爵位，現在規定只有年滿15歲，接受完基本教育，通過考核的才能襲爵，避免+親王，兩個月大的云騎尉這樣的尷尬場景。
由于大批親貴已經在叛亂中被消滅或褫奪爵位，剩余的前不久都晉封了一級，因此《爵位法》的頒行並未受到阻力，而由于功臣爵與宗室爵的一體化，讓所有輿論都評論認為，皇帝實踐“滿漢一體”、“融合域”的目標是努力且真誠的。
維新四年正月過後，全天下的臣民都在關注皇帝的子嗣與將來的地位繼承，根據《帝國日報》披露的消息，再過半個月，陳璿和容齡都將臨盆，她們兩人誰能能誕下皇子，誰家就有可能入繼大統，甚至還有可能問鼎中宮……