史書上有"依日月之末光"之說，也就是說依附和沾染名人之余澤的，大多會成就一番功名事業。徐複觀在他自述體《末光碎影》的回憶中，在國共合作的抗戰期間，他曾以少將軍銜、軍令部聯絡參謀的名義派駐延安，曆時半年。
1943年，國民政府主席林森辭世，延安的中共召開追悼大會，大會由吳玉章主持。徐複觀說吳玉章並不報告林森的生平，而是粗言穢語，對蔣介石加以詆毀，他一時氣起，要求登台發言，結果被"今天沒有安排徐參謀發言的節目"為由加以拒絕。徐複觀要退席，門衛不予放行，他後來又以絕食來抗議。
結果第二天周恩來寫來長信道歉，葉劍英親來招待所安慰。當時徐複觀已看出國民黨的弱點和敗相，其症結是在民主和農民問題上面，並認為中共志在奪取全面政權，而且其勢難擋。至于以後國民黨偏安海島後的所謂"光複大業"，他認為這亦是難以想象的黃粱美夢。
徐複觀不認同國民黨偏安後的"光複大業"，對"台獨"勢力更是深惡痛絕。1972年寫作《"台獨"是什麼東西！》一文，對當時一些否認自己是中國人，而自稱"否莫沙人"的"台獨分子"予以嚴厲的抨擊。
1981年3月底，徐複觀在美國休斯敦的小兒子徐帥軍處住了兩個多月，他一面在美國得克薩斯大學安德遜癌症中心接受診治，一面躺在病床上堅持每天寫作《中國經學史基礎》。他拼了生命最後一點力量完成了這本書，但結果仍讓他不是很滿意，只能感歎自己是無法完成一部完整的經學史了。
徐複觀覺得已經活到這麼大年紀了，死去已經無所留戀，只可惜他想寫《漢代經學史》，這是一個冷題目，他不寫沒有人會做，現在竟沒有動筆的機會了。老友胡秋原建議他口述大綱，由學生代為整理內容，但手術後他的身體日漸衰弱，已經無法把話說清楚。他常想忘了年紀和病痛，在中國文學批評史中選擇若干關鍵問題，寫出十余篇左右深入而具有綱維性的文章，以完成這方面的心願，然而這一切都已成為夢想。
徐複觀臨終之前，自覺壯心未酬，時不我待，在台大醫院病室口述他最後的遺作《中國思想史論集續編自序》時，不無遺憾地說道："'程朱異同'一文，以'為己之學'貫通孔孟程朱陸王學派，老莊對知識與人生的態度與儒學異，但其學問方向亦與此相通，此乃余最後體悟所到，惜得之太遲，出之太驟，今病恐不起，亦未能繼續闡述為恨。"一個"太遲"，一個"太驟"，蘊涵著這一代學者的幾多心血，幾多遺恨！
徐複觀在近50歲時由一個赳赳武夫漸成文化人，一直保持勃發的學術生機，顯示的不純粹是自然生命，而更是一種文化生命、一種精神生命，他背後有一個強大的精神支柱，這就是孔子為代表的滲透到他的血脈骨髓里的中國文化。孔子作為儒家文化的創始者，是民族幾千年傳承不息的文化根基，自春秋開始的祭孔是國之大典，到曲阜去祭孔成了徐複觀在彌留之際最大的期望。