總統安全局的組織機構有：總統團，也就是人們通常所說的總統衛隊，總統保鏢的管轄處。這個團在總統安全局中占有特殊的地位，它的前身就是克里姆林宮獨立團。它是一個純軍事組織，下轄１２個營，每個營大約有３００人。該團士兵大多來自俄羅斯的歐洲部分，人員的挑選十分嚴格，必須忠于總統，身體和心理素質良好。該團駐紮在克里姆林宮的紅牆內。總統安全局的下屬組織還有部署在莫斯科重要市區的第２７特種摩托化步兵旅、警衛局（前克格勃九局）、“阿爾法”特種部隊、前克格勃第五總局的若干偵察機構、前克格勃技術偵察局的基地機構等。在這些機構中，直接負責總統保衛的總統衛隊僅有數百人，其中４４人經常作為貼身保鏢隨同總統參加各種活動。
在總統安全局，還有一個預測分析處，這是最重要的部門之一。這里有許多精通業務的專家，分析整理來自各種渠道的大量情報，判明和辨別情報的真偽虛實，力爭在危險發生前予以制止，並設法消除或預防各種危險隱患。
說總統衛隊是總統權力的“護身符”一點也不誇張，戈爾巴喬夫和葉利欽兩位總統對此都頗有體會。
在“８．１９”事件之後，當戈爾巴喬夫從克里米亞返回莫斯科時，立即宣布自己重任蘇聯總統。但幾經周折的戈爾巴喬夫已成了有名無實的“光杆司令”，連他的貼身衛隊也都紛紛離開了他。當時任俄羅斯代總統的葉利欽卻擁有一支以科爾紮科夫為首的完全忠于他的強有力衛隊，在這支衛隊的保護下，葉利欽帶著他的助手堂而皇之地駐進了克里姆林宮，作為蘇聯總統的戈爾巴喬夫只得遷至克宮的１號樓，並且只能按照葉利欽的要求來任命各部部長。戈爾巴喬夫雖然極為不滿，但卻絲毫沒有辦法，甚至還得熱情地與葉利欽的衛隊長打招呼。戈爾巴喬夫沮喪地對葉利欽說：“您非常幸運，因為您有一支十分忠于自己的衛隊，而我就沒有那麼好運了，我的衛隊早已背叛我了。”這句話正是戈爾巴喬夫對自己那麼快就失去總統權力發自內心的總結。
說到俄羅斯的總統衛隊，人們當然記得它的創始人科爾紮科夫少將。葉利欽總統將他當作自己“最信任的人”是非常有道理的。
科爾紮科夫從１９８０年起就在克宮總統團服役，曾任過前蘇共中央總書記安德羅波夫的貼身保鏢。從１９８５年底就追隨于葉利欽總統，在此後的１１年里，可以說是與葉利欽生死相隨，榮辱與共。
當葉利欽升為蘇共中央政治局候補委員和莫斯科市委書記時，科爾紮科夫中校負責葉利欽的警衛工作。當葉利欽被貶，失去了克格勃警衛局提供的服務時，科爾紮科夫被轉入了預備役。１９８８年２月，他隨葉利欽到建築部當專員。在葉當選為俄聯邦總統後，他重新回到克宮，擔起了葉利欽的安全勤務主任。
在追隨葉利欽的１１年間，科爾紮科夫多次在極危險的情況下保障了葉利欽的安全。特別是在１９９３年１０月的炮擊“白宮”事件中，靠科爾紮科夫精心周密地組織、總統衛隊拼死保護，並堅決支持和協助裝甲坦克部隊開進莫斯科，葉利欽才得以脫險。
科爾紮科夫組建了一支絕對效忠于葉利欽的總統衛隊，他對葉利欽的忠誠是眾所周知的，被葉利欽身邊的人戲稱為“貴族老爺的奴仆”。葉利欽對他也心存感激，視為心腹，使他的軍銜從少將升為中將，１９９６年，又讓他晉升為俄總統安全局局長，享受俄聯邦部長級待遇，並被任命為總統第一助手。
科爾紮科夫的權力越來越大，１９９６年竟擅自逮捕了葉利欽選舉班子中的兩名主要干將，原因是他懷疑這兩個人為獲得葉利欽的歡心，從政府預算中挪用５０萬美元。他沒想到這會使他與葉利欽總統的關系走到了盡頭，他被葉利欽革了職，同時有１００多名安全勤務人員被清洗出總統衛隊。
有人認為，科爾紮科夫被革職的真正原因是“撈的太多，付出的過少”。據《莫斯科新聞》透露，科爾紮科夫及其手下的軍官們干著“形形色色令人咂舌”的事情，他們經營石油、武器、貴重金屬和珠寶等物品，從中賺取了為數不少的錢財。科爾紮科夫失去了總統安全局局長的職務，接替他任俄聯邦總統安全局的是庫茲涅佐夫。