草鹿在南云講話之後強調：“本次作戰的成功，取決于魚雷攻擊。”
然後，源田解釋了這項計劃，他利用瓦胡島和珍珠港的模型，指出攻擊的各基地和各軍艦的位置，把不同的目標分給不同的飛行隊，著重強調了專業化。例如，分配對軍艦進行俯沖轟炸的飛行隊，應把訓練集中在這項專業任務上，不能把時間浪費在任何其他目的上。
這次兩小時的會議結束時，第1航空艦隊在通向珍珠港的路上又走過了一個里程碑。這次重要的會議，不僅擴大了知情者的圈子，而且賦予南云艦隊中的關鍵的軍官們一種方向、目的和緊迫感。
當山本了解到“加賀”號上的熱情和積極進行的計劃工作時，感到很高興。但這時，他更加關心的是對他這一計劃的反對意見。他知道，即便是南云和草鹿這些與他關系最密切的高級將領，直到目前為止也還沒有改變他們內心的疑慮，他們僅僅是屈從于自己高居于上的意志和權威，才不得不加緊進行作戰准備。
“在聯合艦隊里，有一些將軍反對攻擊珍珠港。”他在和草鹿及大西談話之後不久，對渡邊說。他沉思著又說：“也許，依靠能夠信賴的年輕軍官會更好些。”
在這一思想指導下，山本將更多的事情，交給了源田和淵田。山本真心喜歡這兩位有進取心的年輕軍官，他看重淵田作為飛行員的技術和領導者的能力，他把源田當作“獨一無二的優秀的”思想的真正的源泉，評價很高。
山本對第1航空艦隊的訓練工作有深深的個人興趣，不時去鹿兒島、笠野原和有明灣視察。南云、草鹿和大石也多次來“長門”號，和山本、宇垣及黑島會面。但是，幾乎每次會面，第1航空艦隊的高級領導們都會因對珍珠港作戰的懷疑而使山本掃興，搞得山本開始擔心起飛行員的士氣了。
山本十分清楚，司令官的態度會對手下產生影響，所以有時他派佐佐木直接去找源田詢問飛行員的精神狀態。山本對他的這些“鷹”的關心程度遠遠勝過對南云的關心，如果有必要，他可以把南云換掉，但他卻不能把第1航空艦隊的所有飛行員都解職。源田也很理解山本的心思，所以他每次都讓佐佐木確信士氣是好的。
源田和淵田可以自由進出設有瓦胡島和珍珠港模型的草鹿的座艙。因為草鹿也十分看重這兩個人。他要源田和淵田按個人意志自由地顯示他們的能力，他將盡可能采納他們的建議，平心靜氣地注視著他們的活動。他的態度是默認源田和淵田在第1航空艦隊中對珍珠港作戰的個人作用。這就使南云處于難堪的境地：在一個自己陌生的世界里被一群行動自如的人所包圍。吉岡說，這位將軍“在第1航空艦隊中的處境，有點像一個過繼來的兒子……他在飛機的氣氛中茫然，感到不安全，不得不想辦法減輕自己的煩惱。”
當然，源田和淵田也有他們自己的煩惱，主要是一些戰術和技術問題不好解決。到這時，他們已決定在襲擊珍珠港時派出兩個攻擊波，因為同時派出南云的全部飛機，從技術上說是不可能的。淵田將率領第一攻擊波，島崎將在大約一小時之後率第二攻擊波出擊。源田之所以選中島崎，是因為他在第二波的飛行員中資曆高，了解自己的工作，同時也是一位有魄力的領導人。
令淵田十分頭疼的一個問題，是如何才能研制出一種能擊中並穿透美國戰列艦甲板的高空轟炸炸彈。海軍從9月底開始，對一種由16英寸炮彈改裝成的炸彈進行試驗。海軍少將上野敬造領導的橫須賀海軍航空隊，在霞浦東南的鹿兒島機場進行著這些實驗。實驗已進行了大約10天，還沒有命中一次。在這種情況下，上野要求南云派一些最好的飛行員帶著飛機來，看看他們能否改進局面。
南云很敏感地領悟到了這種實驗的深遠含義。他急忙召來淵田，說明情況。“這次實驗事關重大，”他鄭重地說，“它決定著攻擊珍珠港的成敗。你馬上帶上技術最熟練的飛行員去鹿兒島。如果那里的靶子不夠大，必須不顧代價把它放大，它應模仿美國戰列艦‘西弗吉尼亞’號。”他進一步指示淵田要最嚴格地保密，“你不能說出一點有關珍珠港計劃的事，甚至也不能給別人以任何線索。”