洪秀全立發妻賴氏子洪天貴為王儲，稱幼天王。洪秀全覺得洪天貴這名字比較平庸，不能體現天家威儀，更不能顯示洪家受天父眷顧，"仙福永享，壽與天齊"的顯赫，于是洪秀全妙筆生花，點石成金，加一"福"字于其後，改為洪天貴福。某作家曾說過，在越少的字里越能體現一個人的文字品位。洪秀全這一"福"字，向世人昭示了他與眾不同的高雅格調。據研究太平天國的史學泰斗羅爾綱先生說，洪天貴福是個很聰明的兒童，連精通中西文化博學多能的干王洪仁■，讀書的本事也只有他三分之一。（《太平天國史》卷四十二：洪天貴福是個很聰明的兒童，精通中西文化博學多能的干王洪仁■說他自己看一行書，洪天貴福已經看三行了。）依筆者見，聰明不聰明不太好評價，洪天貴福的詩文倒是大有其父之風：
如今我不做長毛，一心一意輔清朝。清朝皇帝萬萬歲，亂臣賊子總難逃。
哥別妹，妹別哥，別上天，無別魔。瞞天混雜是妖魔，妹大五歲手別摸，妹大九歲遠別清。男行女行不同坐，妹長成時不相見，遵條分別福江河。（《太平天國史料彙編》卷一）
冊立洪天貴福之外，洪秀全設立百官：分封五軍主將，以楊秀清為中軍主將，蕭朝貴為前軍主將，馮云山為後軍主將，韋昌輝為右軍主將，石達開為左軍主將；洪秀全又拜軍師，拜楊秀清為左輔正軍師，蕭朝貴為右弼又正軍師，馮云山為前導副軍師，韋昌輝為後護又副軍師。按馮云山制定的軍師負責制，由正軍師楊秀清主持一切大小軍政事務，軍師下屬吏、戶、禮、兵、刑、工六部尚書，每部十二員，共七十二員，主分掌國務；承宣二十四員，主發號施令。全國國務，各方向正軍師稟奏，由正軍師楊秀清發出誥諭指揮。在馮云山的設計中，國家元首是"主"，行政長官卻是"軍師"，為"朝綱之首領"，負責辦事，"主"洪秀全則無事一身輕，獨自偷歡。中國在朱元璋廢宰相前，多數時期在行政上實行君相分權，嚴格區分皇室和政府，皇帝是國家元首，宰相則是政府的行政長官。皇帝任免宰相，但具體的行政事務如國策方針、官員升遷、錢糧差役、水利農桑，都由宰相實際負責，皇帝不得與聞。（唐朝中宗皇帝越過宰相，私授官職于親信，發到地方的詔書不好意思使用朱筆封"敕"，改用墨筆，詔書的封條也只能斜貼著從宮廷的側門發出，意思是讓下面的官員馬虎承認算了，被封的官員人稱"斜封官"，極遭士林鄙視。）此項制度的立意，在于皇帝世襲，難免出現不肖無能之輩，如勉強使其執政，不免禍害國家，而宰相由全國英才挑選，不稱職還可罷免，政務交由宰相，在一定程度上抵消君權世襲的危害。明、清兩代，政治腐敗黑暗，正因朝中無宰相的緣故，黃宗羲曾說，"有明之無善治，自高皇帝罷丞相始也"，馮云山飽讀詩書，對黃宗羲總結這一曆史教訓自然印象深刻，所以他創制太平天國，一意要恢複漢唐相制。但引經據典，太平天國高層的大老粗領袖多不明白，于是只得援引《三國演義》，劉玄德事事聽從軍師諸葛孔明的例子，將宰相名目，勉強改稱軍師。馮云山勞苦功高，又極富才干，在起義前也儼然拜上帝教唯一軍師，孰料半路殺出楊秀清和蕭朝貴，馮云山竟只混了個副軍師，受楊秀清節制，真是倒黴到家了。所幸馮云山不好與人爭勝，是天生的第二把手性格，坦然接受了楊秀清的領導地位，馮云山的胸懷，頗有古人之風。
萬壽慶典，形勢大好，洪秀全心情愉快，納了二十一個新妃，合其先在大湟江娶的十四個小妾及原配賴氏，共設三十六宮，"母儀天下"。楊、馮、蕭、韋、石諸人也紛紛與上百名女教徒喜結良緣。據被清廷俘虜的拜上帝教細作李進富供稱，洪秀全、楊秀清、馮云山等六個王"每人妻妾三十六口"。
太平天國高層在宣布建號的同時，也在進一步整頓軍隊，為即將到來的慘烈戰作斗准備。大概在東鄉廣納妃妾，太平天國眾軍師也感到自己精力衰竭，無心打仗。聰慧過人且勇于反省的軍師們，立刻意識到性生活會使士兵意志消磨，喪失戰斗力，于是以洪秀全為首高瞻遠矚地下達男女分營的命令，使士兵禁欲。洪秀全頒布軍紀"別男行別女行"，禁止夫妻房事，夫婦要分營別居，男女私下約會一經發現即處以斬首極刑，雖夫婦也不得免。這項制度執行得十分嚴格，冬官右正丞相陳宗揚因與妻子同居，夫妻均被斬首。楊秀清的座賓盧賢拔，人稱盧先生，因巡營時發現自己妻子，帶入自己官邸相會二日而被判極刑，經楊秀清竭力開脫勉強脫難，楊秀清為保盧賢拔不得不假借天父下凡以枉法為由下令杖責自己六十下（老楊還真講義氣）。三軍將士激烈反對男女分營，後來連洪秀全最寵信的重臣，每年生日給洪秀全保六次大媒的皇媒蒙得恩也在擔任女館頭目時監守自盜，這項制度不得不在推行二年後廢除。