他接著采取步驟來削除國民黨的武力。他首先暗殺國民黨的政治領袖宋教仁，接著下令解除南方各省所有國民黨將領督軍職務，企圖激起各省的反抗，然後加以武力掃蕩。孫中山先生想發動二次革命而沒有成功。這時候袁世凱差不多已經以武力控制全國，于是借口這次"叛變"，預備取消國會中國民黨籍議員的資格。南方被他鎮壓住以後，他的野心愈來愈大；亟欲攫取更大的權力和尊榮。民國四年他正預備自立為皇帝時，各省紛紛通電反對，因此被逼放棄皇帝夢，旋即憂傷而死。
民國六年(一九一七年)，孫中山先生在廣州建立根據地，希望在那里成立一支軍隊的核心，發動新革命而推翻軍閥，不料在民國十一年(一九二二年)反被廣州軍閥陳炯明所推翻。不過翌年孫先生終于在廣州成立新政府，國民革命運動聲勢得以重振。但這僅是一個開端。自從野心勃勃而不擇手段的袁世凱死了以後，中國一直四分五裂，各省之間內戰頻仍，政局擾攘達十二年之久，直到民國十七年(一九二八年)蔣總司令北伐成功，國家才重歸統一。
中華民國成立以後，十六年來中國一直掌握在軍閥手里。內戰一次接著一次發生。這些內戰多半還是外國勢力慫恿和支持的。內戰的結果，國力損耗，民生凋敝，並且為日本侵略鋪了路。革命前途似乎黑暗一片。內戰中獲勝的軍閥趾高氣揚，野心愈來愈大，不斷爭取更大的權力。被擊敗的軍閥則夾起尾巴躲在天津和上海的租界里待機再起，機會一來就重啟戰釁，使人民又增加一場災禍。
一度被鄙視，後來受尊重的軍人，現在又再度被人鄙視了。