傅斯年寫下"歸骨于田橫之島"，筆墨之間滿蘸著田橫五百士的悲壯，字句之中彌滿了淒愴之感。沒想到傅斯年竟一語成讖，最後真的埋骨于這片遠離大陸的孤島，所以屈萬里曾建議將這七個字刻在傅斯年的墓碑上。
元氣淋漓滿台大
1949年1月20日，傅斯年正式就任台灣大學校長，並繼續兼任曆史語言研究所所長職務。台大此後在傅斯年披荊斬棘引領之下，成為了台灣的最高學府與學術中心，並以豐富的研究資源以及自由的校風而聞名。假如沒有傅斯年，台大在那樣動蕩的時局中，想要在短時間內迅速崛起，奠定一個現代大學的基礎，並如日中天地發揚光大，的確是難以想象的。
傅斯年當初接手這個燙手山芋時，台大無疑是個人人望而生畏的爛攤子。台大是以始創于1928年的台北帝國大學為前身，乃日本殖民台灣時代所建立。抗日戰爭勝利後，台灣經過半世紀的異族統治，終于擺脫了帝國主義的桎梏，從侵略者手里重新回歸祖國的懷抱。國民黨政府接管了台北帝國大學，並于1945年11月正式更名為國立台灣大學。
當時中國大地戰云密布，兵馬倥傯，注定民國政府對台灣政治、經濟的重建心有余而力不足，動蕩的局勢波及到台灣島內，使得島內出現貪汙橫行、物資短缺等亂相。可想而知，這時的台大日子肯定也好不到哪里去，加上學校里管理紊亂、學潮迭起，辦學經費不能及時足額到位，連師資都很匱乏，各種問題亂成一鍋稀粥。
台大校長也像走馬燈似的頻繁更換，三年換了三個校長。第一任校長羅宗洛原是中研院植物研究所所長，抗戰結束後，他被派往台灣接收台北帝國大學，並將其改名為國立台灣大學。他上任後百廢待興，建設經費短缺，日籍教師都已撤回，國內教授又聘請不來，校務、教學工作無法上軌，百般無奈之下，于1946年8月辭職回去繼續當他的植物研究所所長了。
第二任校長陸志鴻來後，台大經濟入不敷出，工作無法開展，他面對荊棘叢生的問題知難而退。
第三任校長是著名化學家莊長恭，于1948年6月到達人地兩生的台灣。他原想辭退一批與當時權貴有裙帶關系的教師，但當即遭到當局的反對，面對日趨反動的環境，無奈的他不願意留在孤島之中，毅然在1948年底返回解放在即的大陸。
台大的幾任校長中，任期長者不到兩年，短者僅數月。校長頻繁易人，校務工作很久未能步入正軌。傅斯年到任之前，莊長恭只讓學醫學的杜聰明來代理校長。杜聰明這位台灣第一位醫學博士，精于科研，卻在大學管理方面束手無策。
傅斯年上任後跟李書華抱怨道："弟到此辦此一大學，真正上當，大概說來：辦一新大學容易，改革一個舊大學難。弟在北大任內，多是老朋友，吵架固多，辦事也有甚愉快處，此地是'接受別人的雜牌隊伍'。基于政治形勢，此地請人大不易也。簡直請誰誰不來。"