核查人員當時認同了他的說法。
不過他們還提出，蘇聯每年報告的死于黑死病的人並不多。可見，黑死病並不像尤拉科夫博士說的那麼嚴重。他們還特別指出，一些簡單的抗生素就可以有效的控制住黑死病。
尤拉科夫博士回答說，像蘇聯這樣的大國，進行這種研究是“研究的需要”。
核查人員接著詢問一些有關基因工程的問題。這種研究的需要是不是還包括運用基因工程將黑死病病毒改造為武器？
尤拉科夫博士的回答令人擔憂。他暗示他的手下正在研究黑死病菌株，這些菌株具有不可思議的致命危害性——你可能不相信這些菌株的存在。他聲稱它們只是天然菌株，並且疫苗對這些菌株沒有任何免疫作用。核查人員覺得他是在吹噓他的屬下在基因工程方面取得的成就，但也不能確定。尤拉科夫和他的同事們提出可以和美國進行技術轉讓，這使得核查人員感到十分震驚。由此，美國將有機會了解奧博思科的發現——只是不知道這個轉讓的價格是多少。他們還暗示說，美國在生物武器領域已經遠遠落後于蘇聯，所以核查只是一個幌子而已——只是一個美國人想窺探蘇聯科學家的研究成果的借口，美國希望從而能夠追趕上蘇聯。
事實上，把抗生素基因導入細菌很容易——那只是一個基本技術，沒什麼神奇的。西方情報部門隨後的報告表明，奧博思科黑死病菌株能夠抵抗16種抗生素以及核輻射。如果蘇聯人的確培養了出了這種菌株的話，那麼他們是怎樣培養的——這些都不為人知。他們是運用基因工程還是運用傳統的不斷嘗試的方法培養的這些菌株？不管怎樣，美國已經蘇聯政府發出聲明，要求蘇聯政府做出解釋，蘇聯是否真的將對很多種抗生素具有抵抗作用的黑死病菌株用于武器生產。蘇聯科學家和政治領袖直到今天也沒有對該問題做出合理的回答。他們只是進行了含糊其詞的否認。
“奧博思科黑死病菌株是一種非常可怕的東西，”利特勒貝里說。“它基本上無藥可救，並且在人群種傳播的速度極快。如果有人在巴黎市散布1英鎊的奧博思科黑死病菌株，巴黎周圍的人都別想逃生。我們最擔心的問題之一是：蘇聯政府似乎對這種軍用菌株已經失去了控制。
核查小組飛往西伯利亞西部的新西伯利亞市。在該市東部20英里的一片白樺林和落葉松林中，坐落著新西伯利亞分子生物學研究所，其內部約有30座建築物。這些建築物內有許多蘇聯設計風格的環形熱區。這里的研究的核心是病毒——埃博拉病毒、馬爾堡病毒、來自南美洲的一種大腦病毒(委內瑞拉馬腦炎病毒)、克里米亞半島－剛果的出血熱病毒、虱類傳播的腦炎（另一種大腦病毒），以及馬丘波病毒（玻利維亞出血熱病毒）。
調查小組獲悉新西伯利亞分子生物學研究所擁有數台培養天花病毒的生物反應器。從反應器的規模可知，蘇聯軍方的天花病毒生產能力達到每年數噸。
利特勒貝里當時感到十分震驚。“那是我一生中感覺最糟糕的時刻”，他對馬薩喬說，“我一直想著那些印度和非洲的醫生，他們一點點地同天花病毒做斗爭。但同時，生物備戰研究所這個怪物卻在成噸地生產天花病毒。”
隨後的核查發現新西伯利亞分子生物學研究所並不是蘇聯唯一進行天花病毒武器生產的研究所。另外兩個地方也有進行同樣工作的工廠。一個是位于莫斯科附近一座叫做劄格爾斯克（現名叫坡薩德）的城市內，另一個位于波格羅夫市內。
利特勒貝里說：“你是不是聽說過蘇聯已經把所有的天花病毒都放在一個冷庫里了？這種說法純粹是胡說。蘇聯國防部把留存的天花病毒分別保存在多個地方的軍用冷藏庫中。蘇聯軍事人員是不會放棄他們的天花病毒的，絕對不會。天花是一種戰略武器。尤其是在天然病毒已經從人群中消失以後，它們更顯得彌足珍貴。”地球上的大多數人已經失去了對天花的免疫力。所以它們具有很強的傳染性和破壞性。一個感染者可以很輕易的感染20多個人，所以在缺乏免疫力的人群中的小規模爆發會很快導致大面積的人群感染。“我們都認為我們有免疫力，不會被感染，因為我們在兒童時期都注射了天花疫苗”，利特勒貝里說道，“不幸的是——天花疫苗在注射10到20年後就會失去作用，除了軍人之外，公眾最後的一次疫苗注射是在20年前。軍人現在仍然接受天花疫苗注射。”