研究已經表明，近來被作為補給品的益生菌有機物包含類似于二肽酰肽酶IV的物質（如PepX），它也能夠消化外啡肽。人體腸道中大約有10萬億個微生物體，它們所含酶的運動的貢獻大大超越腸道細胞的貢獻。據可靠記載，半乳糖就是一種益生元（更確切地說，它能夠刺激益生菌增長），並能提高腸道中益生菌的數量。
人們在對孤僻症患者的治療中（和在使用益生菌治療其他各種症狀中）發現，隨著時間的推移，同樣的益生菌對身體產生的積極作用越來越少。近期，我在使用脈沖調制和轉化益生菌的布魯奈克治療法中提到了這一點，這是我第一次設想並寫下這一理論。
10年前，大多數益生菌產品都含有嗜酸性乳酸菌或雙歧杆菌。如果有人足夠幸運，他或她還能找到同時含有這兩種物質甚至含有另外兩種酸奶酪細菌（保加利亞乳杆菌）化合物的產品。大部分這類產品在加工時含有將近1億個活性細胞。雖然這聽起來像是有很多有機體，特別是當我們以細菌都是壞的這一觀點為前提時更是如此，但是最新的數據表明這個數量太少了，以至于益生菌無法發揮出太多的有益作用。至少在應用益生菌進行短期治療時確實是這樣的。
那麼，10年來發生了怎樣的變化呢？隨著越來越多的數據的出現，人們已經清楚地知道，要達到任何實際的臨床效果，每劑中至少需要含有10億個有機生物體。在最近的一項研究中，研究人員每天通過攝入牛奶為被研究人員提供100億個雙歧杆菌，並注意觀測他們身體的免疫情況的變化，最終發現粒性白細胞吞噬細胞的活動能力大大增強了。
還有一項研究著眼于觀測益生菌在癌症患者體中阻擋感染源的防禦作用。30名病患參加了這個實驗。從病人最初接受化療開始，每天分3次向病人提供乳杆菌膠囊，每次2粒，持續30天。每粒膠囊都包含以50：50比例混合的雙歧杆菌和嗜酸性乳酸菌。每粒膠囊中含有40億個有機體。發燒現象被大大地向後推遲了，從一個中間時間8天推遲到了12天。顯而易見，益生菌在治療像癌症這類最嚴重的病症中，也起到了非常重要的作用。
孤僻症患者血液中的毒性物質（氨）是另外一個研究領域。使用益生菌很容易就能減少循環中的氨。研究人員在一項研究中對盲腸物中（或糞便中）的50億個含有乳酸杆菌或短雙歧杆菌的有機體進行了測試，結果發現盲腸物的pH值相應地下降了。這就為在排毒計劃中使用益生菌提供了依據。
在孤僻症患者群體中，對身體進行全方位排毒是非常流行的一種做法。醫生常用的排毒物質包括DMSA、EDTA這類物質和螯合劑（螯合意味著抓住或包圍某些東西）等。排毒與治療孤僻症有關系，因為從環境中獲得的汞——從周圍的生活或工作環境中吸收的或通過接種疫苗吸收的——是導致孤僻症和心房間隔缺損的罪魁禍首。