方孝孺既死，即位詔書還得有人來擬，成祖找到另一個宋濂的學生，侍讀樓璉。他當面不敢辭謝，回到家對他妻子說：“我甘于學方孝孺那樣而死，但怕連累了你們。”當夜自縊，不負本心。
成祖破京之初，類似的忠烈孤臣，比比皆是，其中有個卓敬，需要特加介紹。卓敬字唯恭，浙江瑞安人，洪武二十一年中進士後，除戶科給事中。給事中與禦史同為言官，禦史以省分道，如“浙江道”、“山東道”等，而給事中配合六部分科，所以合稱“科道”。卓敬為言官時，耿直無所避忌。建文初他上一道密疏，說燕王智慮絕倫，雄才大略，酷類先帝；北平形勝之地，士馬精強，金、元由此而興，所以不宜讓燕王鎮北平，建議徙封南昌，就近監視，萬一有變，亦易于控制。這確是曲突徙薪、防患未然的救時良方，可惜建文帝不聽。
卓敬被捕，成祖雖責以離間骨肉，但頗有憐才之意，把他下在獄中，勸他投降。卓敬不屈，成祖亦不殺。哪知道衍與卓敬有仇隙，便在成祖面前進讒：“如果卓敬的建議見諸實行，皇上哪里會有今天？”成祖因而斬卓敬、誅五族。
至于鐵鉉，本來一直守山東，燕軍南侵，建文帝命東遼總兵楊文領兵十萬會合鐵鉉，絕燕歸路。楊文無用，所部入關，為燕將攔截，無一能至濟南。建文四年四月，鐵鉉與盛庸戰燕軍于淮、徐之西，時有斬獲，不幸平安一軍垮了下來，盛庸亦遭敗績，鐵鉉不得已屯兵淮上。京師淪陷，所部潰散，鐵鉉被擒，解至京師，成祖親自審問，鐵鉉背對殿上，丑詆成祖不仁不義，死時年三十七歲。
明太祖最受人批評的一事，是侮辱衣冠，至成祖又變本加厲，清朝章學誠曾指出：“前朝虐政，凡縉紳籍沒，波及妻孥，以致詩禮之家，多淪北里。”在明太祖時，于南京乾道橋設“富樂院”，罪人眷屬，發此為官妓。成祖處置建文孤忠的妻孥，實在與流寇的作風無甚分別。如《國朝掌故》所記：“鐵鉉妻楊氏年二十五，送教坊司。勞大妻張氏，年五十六，送教坊司。張氏旋故，教坊司安政于奉天門奏，奉聖旨：‘吩咐上元縣，抬出門去著狗吃了。欽此！’”請想，這是什麼皇帝！