普京還有很多有利于他采取行動的資本。其一，普京擔任俄羅斯總統之後，成績斐然。俄羅斯經濟穩步上升，俄羅斯人的希望被重新喚起，民族精神被重新聚集。這些，使得普京的威望如日中天，無人與之匹敵。其二，俄羅斯富豪大都是特殊條件下的產物，幾乎全是暴發戶。他們身上有各種各樣的把柄，俄羅斯人對他們充滿了不信任感。民意測驗表明，80%的俄羅斯人贊同對上個世紀90年代的私有化進行修正，90%的人認為大富豪們的財富是非法獲取的。這為普京收拾霍多爾科夫斯基這樣的人提供了人氣基礎。
當然，普京更希望以敲打的方式，讓霍多爾科夫斯基"回頭是岸"，自然就先下手為強。2003年7月2日，俄以重大盜竊、欺詐等罪名，傳訊、拘捕了尤科斯的搭檔——梅納傑普銀行總裁列別傑夫。7月4日，俄羅斯總檢察院和內務部開始對尤科斯公司進行調查，指控該公司逃漏稅和挪用款項。霍多爾科夫斯基本人與尤科斯前副總裁列昂尼德、涅夫茲林也遭到了傳訊。但霍多爾科夫斯基不但沒有退縮，還全力反擊，利用各種政治力量，向政府施壓。
霍多爾科夫斯基與普京的爭斗達到白熱化狀態，普京只有動手了。
國際輿論普遍認為，普京重錘霍多爾科夫斯基一役是"一石三鳥"。一是霍多爾科夫斯基的被捕促使金融寡頭的最大保護傘沃洛申辭去了總統辦公廳主任的職位。從此，普京徹底告別了"寡頭干政"的時代，告別了葉利欽留給他的政治遺產。二是霍多爾科夫斯基被捕導致普京的三個反對黨財源緊張。反對黨"亞博盧"幾乎100％的財路來自霍多爾科夫斯基，反對黨"正義力量聯盟"的比例是50％，俄共也有很大部分贊助來自霍多爾科夫斯基。三是俄羅斯人討厭金融寡頭，在檢察官們逮捕了霍多爾科夫斯基之後，普京的支持率上升到80%。
2003年9月，霍多爾科夫斯基通過自己控制的媒體公然和政府對著干。在大選期間將霍多爾科夫斯基關起來，可以從經濟上打擊反對派，保證杜馬在大選後繼續控制在支持政府的議員手中。
由于俄羅斯國內嚴重的兩極分化，大部分人都反對寡頭對經濟的控制，支持打擊寡頭新貴的普京。普京也發誓要"讓人民過上好日子"。他強調說："我們的優先方向是保護市場，使其免受達官顯貴和犯罪分子的非法侵入。"
普京打擊寡頭就是為了改變葉利欽時代寡頭控制國家經濟命脈的現狀。
普京整治的寡頭集中在自己第一任期的一頭一尾。普京第一任期的第一篇章是車臣戰爭，第二篇章是"削藩"，第三篇章就是"整治"兩個最主要的寡頭首領——古辛斯基和別列佐夫斯基。這"一頭一尾"的曲線表明，普京都是在寡頭已危及到自己的政治統治或者有可能攪亂政治局面時才出手整治的。
如果從微觀的角度看，霍多爾科夫斯基事件只不過說明，普京政權又"修理"了一個"犯有嚴重經濟罪行"的寡頭，是一個發生在一個大寡頭身上的典型經濟案件。
如果從中觀角度看，這是普京與霍多爾科夫斯基政治角力的結果，是俄羅斯議會與總統大選政治游戲中的一段篇章。經濟案件中折射著深刻的政治內容，或者說，政治問題以經濟案件的樣式來攤牌。
如果從宏觀的角度看，這實際上是普京戰略上的重要一步棋，是普京實施"錢權"分離的重要戰略步驟，更明確地說，是普京力圖徹底擺脫寡頭糾纏，徹底擺脫葉利欽"家族"控制的戰略棋局的開端。
如果從俄羅斯政治時段上看，這個事件表明，完全意義上的普京時代真正到來了。普京既遏制了霍多爾科夫斯基，又徹底擺脫了葉利欽"家族"的控制和監督。
"寡頭"是俄羅斯私有化進程中所催生的十分特殊的產物，寡頭干政早已成為俄羅斯政治進程中的重要現象。
普京在2000年競選總統過程中及之後面臨著兩個難題：第一，普京是葉利欽的接班人，這是他得到寡頭支持的重要原因。寡頭們這樣做與其說是支持普京，不如說是支持葉利欽及其路線。換句話說，寡頭們與其說是支持普京，不如說為了今後能控制普京，其目的還是為了維護自身的最根本利益。在2000年普京競選總統的那段時間里，寡頭對普京所采取的政治策略是，利用原有的與葉利欽"家族"之間的密切關系，積極靠向普京，力圖纏裹住他，進而控制他。普京一方面不能不接受混雜在葉利欽"家族"中的來自寡頭的政治支持，另一方面又不得不與寡頭保持一定的安全距離，隨時警惕寡頭對自己的控制。第二，普京繼承了葉利欽的政治路線和政治遺產，而這種政治遺產中包含著寡頭干政的內容。普京必須扮演這樣的角色，即他是葉利欽的接班人，是葉利欽的政治代表，但決不是寡頭利益的代表。普京必須向社會澄清這樣一個觀念，即葉利欽"家族"與寡頭是一體的，但他與寡頭卻沒有什麼關聯。