隆慶皇帝又對身邊的陳皇後和李貴妃說，爾等……務必……團結……一心，讓太子……做……賢……賢明之……君。
托孤第二天，隆慶皇帝駕崩了，是年，三十六歲。那是天黑後不久，隆慶皇帝剛咽氣，外面刮起了狂風，接著，一陣雷聲之後，風雨大作。
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隆慶皇帝駕崩後，高拱和馮保之間積蓄已久的矛盾，終于爆發了。高拱一向自負、急躁，他對戰勝馮保很有信心，因為，他位列三位顧命大臣之首，而另一位顧命大臣高儀又是他一手舉薦的，性格懦弱，高拱叫他往東，他不敢往西。
那段時間，高拱的府上，夜夜高朋滿座，好不熱鬧。一天，高拱與同僚喝得正高興，管家高旭神色慌張地進來，在他耳邊嘀咕了幾句。高拱邊聽邊皺眉頭，然後，對來客拱了拱手說，諸位，老夫有點急事，要失陪一會兒。
高拱來到書房，高旭掩上門出去了。見到高拱，垂頭喪氣的司禮監掌印太監孟沖忙迎上來請安。這孟沖也是高拱一手舉薦的，兩人的關系非同一般。高拱說，孟公公不必多禮。公公深夜來訪，定有什麼急事吧？孟沖歎著長氣說，真是一言難盡啊。高拱說，出什麼事了？孟沖說，這段時間，馮保經常往兩宮太後那里跑，看來是要將我取而代之了。高大人，你可要給我做主啊。高拱憤怒至極，將手上的茶壺摔在地上，握緊拳頭說，馮保這只老狐狸，分明是沖著老夫來的，老夫絕不會讓他得逞。聽到響動聲，在外面候著的高旭推門而入。高拱說，筆墨侍候。高拱開始寫奏折，痛斥了馮保的種種劣行，要求嚴懲太監專政，消奪司禮監太監的權力，將權力集中于內閣。
第二天一早，李貴妃像往常一樣去慈甯宮給陳皇後請安。陳皇後剛吃過藥，躺在軟椅上，懷里抱著一只白貓，貓很溫順，縮成一團，閉著眼睛，享受著主人的撫摸。見到李貴妃，陳皇後關切地問，太子登基的吉日定下了嗎？李貴妃說，回姐姐話，定在了六月初十。陳皇後點了點頭。李貴妃說，這段時間可真讓馮公公受累了。陳皇後說，本宮有一個想法，不知道妥當不妥當？李貴妃揮了揮手，宮女們都退下了。陳皇後說，先帝說，要當好皇帝，只要用好兩個人，一個是元輔大學士，一個是司禮掌印太監。高拱雖然脾氣暴烈，但向來忠心耿耿，是個可用之人，可現在的掌印太監孟沖只會做菜，其他什麼都不會，怎麼能擔當輔佐新帝的重任呢？李貴妃心頭一喜，裝作吃驚的樣子說，姐姐難道是想另選掌印太監？陳皇後說，這幾天，哀家想得最多的就是這件事情，妹妹覺得誰是最好的人選？李貴妃本想直接說出馮保的名字，但又怕說不到陳皇後的心上，便說，這要姐姐欽點才行。陳皇後說，你覺得馮公公能勝任嗎？李貴妃說，馮公公對朝廷一片忠心，不管是才學，還是資曆，都應該是最合適的人選。陳皇後說，本宮也這麼認為。等太子登基之後，就讓馮保代替孟沖吧。
登基儀式的日子終于來到了。這天，天剛蒙蒙亮，文武百官便早已云集皇極殿，恭候聖駕的到來。太子賴在床上不肯起來，馮保催了一遍又一遍，他才很不情願地爬起來。他先去宏孝殿朝拜先帝，太陽初升，他身穿特制的小龍袍，頭戴精致的大龍冠，來到了皇極殿。馮保將他抱上龍榻。
登基大典氣氛十分嚴肅，大殿兩旁陳列著龐大的儀仗隊。漏壺滴到吉時，隨著執事太監一聲吆喝，各種器樂長鳴，幾案上的銅爐冒起了香煙。大臣們一隊隊排著進來，行三跪九叩首大禮。太子朱翊鈞變成了萬曆皇帝。
本來，萬曆皇帝應該說“平身”，他卻突然從龍榻上跳下來。馮保走過去說，皇上，怎麼了？萬曆皇帝輕聲說，大伴，我要尿尿。馮保說，皇上，請再忍一會兒。萬曆皇帝輕聲說，我已經忍了很久了，怎麼還沒有完啊，再不完，我要尿褲子了。剛說完，就尿在了身上。萬曆皇帝哭了起來。諸位大臣滿是疑惑。馮保說，皇上這是在懷念先帝，情不自禁，所以才會如此動容，由此可見，皇上日後定是體恤民生，宅心仁厚的好皇帝，蒼生有福啊！說完，眾大臣又叩首，吾皇萬歲萬萬歲。